Le Comité directeur d'eCH est formé du président et de douze autres membres de l'association au plus, dont au moins un représentant respectivement de la Confédération, des cantons, des communes et des organisations non gouvernementales (ONG), et, si possible, des consommateurs, de l'économie, des branches des technologies de l'information et de la communication, ainsi que des milieux de l'enseignement et de la recherche.

Les travaux du comité directeur sont règlés dans le règlement intérieur du comité directeur.

L'Assemblée générale élit les membres du Comité directeur et le président.